Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI47

Abcc2, Canalicular multispecific organic anion transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc2Q8VI47 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc2Q8VI47 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc2Q8VI47 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc2Q8VI47 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc2Q8VI47 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc2Q8VI47 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc2Q8VI47 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcc2Q8VI47 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Abcc2Q8VI47 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc2Q8VI47 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc2Q8VI47 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc2Q8VI47 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc2Q8VI47 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc2Q8VI47 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms