Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SelenomQ8VHC3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SelenomQ8VHC3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms