Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms