Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubg2Q8VCK3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms