Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ubxn4Q8VCH8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubxn4Q8VCH8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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