Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5M0

Gipc3, PDZ domain-containing protein GIPC3, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc3Q8R5M0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gipc3Q8R5M0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc3Q8R5M0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms