Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg10Q8R1P4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg10Q8R1P4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms