Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms