Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ltbp4Q8K4G1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ltbp4Q8K4G1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ltbp4Q8K4G1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms