Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin28aQ8K3Y3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms