Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh16f2Q8K3M1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms