Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vrk3Q8K3G5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vrk3Q8K3G5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vrk3Q8K3G5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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