Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lrrtm1Q8K377 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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