Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc12Q8K2L8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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Trappc12Q8K2L8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Trappc12Q8K2L8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Trappc12Q8K2L8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Trappc12Q8K2L8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Trappc12Q8K2L8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms