Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tbc1d23Q8K0F1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbc1d23Q8K0F1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms