Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkn3Q8K045 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkn3Q8K045 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkn3Q8K045 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkn3Q8K045 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkn3Q8K045 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkn3Q8K045 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkn3Q8K045 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkn3Q8K045 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkn3Q8K045 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkn3Q8K045 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkn3Q8K045 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkn3Q8K045 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkn3Q8K045 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkn3Q8K045 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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