Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms