Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf628Q8CJ78 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf628Q8CJ78 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms