Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Prmt5Q8CIG8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Prmt5Q8CIG8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Prmt5Q8CIG8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Prmt5Q8CIG8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Prmt5Q8CIG8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Prmt5Q8CIG8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Prmt5Q8CIG8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Prmt5Q8CIG8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Prmt5Q8CIG8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Prmt5Q8CIG8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Prmt5Q8CIG8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prmt5Q8CIG8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms