Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NgefQ8CHT1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NgefQ8CHT1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms