Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp2Q8CGR7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms