Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd4lQ8CFI0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms