Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms