Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms