Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RybpQ8CCI5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms