Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf170Q8CBG9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf170Q8CBG9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf170Q8CBG9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnf170Q8CBG9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnf170Q8CBG9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rnf170Q8CBG9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rnf170Q8CBG9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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