Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrn3Q8CBC6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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