Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc159Q8C963 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc159Q8C963 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms