Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vwc2Q8C8N3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vwc2Q8C8N3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vwc2Q8C8N3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms