Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933409G03RikQ8C5U0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
4933409G03RikQ8C5U0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933409G03RikQ8C5U0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933409G03RikQ8C5U0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933409G03RikQ8C5U0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4933409G03RikQ8C5U0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms