Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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