Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc90bQ8C3X2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms