Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C3W1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C3W1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C3W1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8C3W1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8C3W1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms