Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ssuh2Q8C3L1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ssuh2Q8C3L1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ssuh2Q8C3L1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ssuh2Q8C3L1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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