Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rft1Q8C3B8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rft1Q8C3B8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms