Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg16l1Q8C0J2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms