Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FarsaQ8C0C7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FarsaQ8C0C7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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FarsaQ8C0C7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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