Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx16Q8C080 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx16Q8C080 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx16Q8C080 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx16Q8C080 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Snx16Q8C080 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Snx16Q8C080 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx16Q8C080 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx16Q8C080 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx16Q8C080 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Snx16Q8C080 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx16Q8C080 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx16Q8C080 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx16Q8C080 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Snx16Q8C080 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Snx16Q8C080 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx16Q8C080 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx16Q8C080 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Snx16Q8C080 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Snx16Q8C080 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Snx16Q8C080 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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