Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TnrQ8BYI9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TnrQ8BYI9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms