Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp47Q8BY87 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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Usp47Q8BY87 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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Usp47Q8BY87 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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Usp47Q8BY87 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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Usp47Q8BY87 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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Usp47Q8BY87 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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Usp47Q8BY87 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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Usp47Q8BY87 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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Usp47Q8BY87 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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Usp47Q8BY87 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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