Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec22cQ8BXT9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec22cQ8BXT9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec22cQ8BXT9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec22cQ8BXT9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec22cQ8BXT9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec22cQ8BXT9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec22cQ8BXT9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec22cQ8BXT9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sec22cQ8BXT9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec22cQ8BXT9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms