Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp5Q8BX09 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp5Q8BX09 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms