Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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