Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmd4aQ8BIE6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmd4aQ8BIE6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms