Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cyp4f39Q8BGU0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms