Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms