Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Jmjd4Q8BFT6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Jmjd4Q8BFT6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms