Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.3Q85ZW6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms