Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4cQ811C2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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Atg4cQ811C2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms