Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Liat1Q810M6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Liat1Q810M6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Liat1Q810M6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms